LSHParameterEstimator

Full name Microsoft.VisualBasic.Math.HashMaps.MinHash.LSHParameterEstimator Assembly Microsoft.VisualBasic.Math.Core Members 3

01 Syntax

Microsoft.VisualBasic.Math.HashMaps.MinHash.LSHParameterEstimator

02 Methods

Name	Overloads	Summary
GetThresholdFromIdentity	1	核心推荐函数：根据目标序列一致性，计算应该使用的 MinHash 相似度阈值
EstimateLSHThreshold	1	估算当前 LSH 参数对应的“临界相似度” 相似度高于此值的序列有极高概率被选中，低于此值的极大概率被过滤
RecommendConfig	1	辅助工具：根据目标相似度推荐 b 和 r 的配置

03 Members

method GetThresholdFromIdentity #

GetThresholdFromIdentity(Double, Int32)

核心推荐函数：根据目标序列一致性，计算应该使用的 MinHash 相似度阈值

Parameters

Name	Type	Description
`targetIdentity`	`Double`	目标序列一致性 (如 CD-hit 的 0.8)
`k`	`Int32`	k-mer 大小

Returns

建议的 MinHash Jaccard 阈值

method EstimateLSHThreshold #

EstimateLSHThreshold(Int32, Int32)

估算当前 LSH 参数对应的“临界相似度” 相似度高于此值的序列有极高概率被选中，低于此值的极大概率被过滤

Parameters

Name	Type	Description
`numBands`	`Int32`	波段数
`rowsPerBand`	`Int32`	每波段行数

Returns

LSH 临界阈值

method RecommendConfig #

RecommendConfig(Double, Int32)

辅助工具：根据目标相似度推荐 b 和 r 的配置

Parameters

Name	Type	Description
`targetJaccard`	`Double`	目标 Jaccard 相似度
`totalHashFunctions`	`Int32`	总哈希函数数量 (如 100)

Returns

建议的波段数和每波段行数