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先验调控网络
PriorNetwork
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.BNLearn.Core.PriorNetwork
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| AddEdge | 1 | 添加调控关系 |
| GetRegulators | 1 | 获取指定靶基因的所有上游TF |
| GetTargets | 1 | 获取指定TF的所有靶基因 |
| ToWhitelist | 1 | 转换为白名单边列表（使用基因表达矩阵的索引） |
| GetAllGeneNames | 1 | 获取所有涉及的基因名 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Edges | 1 | 调控关系列表 |
| TFNames | 1 | 所有转录因子名称 |
| TargetNames | 1 | 所有靶基因名称 |
04 Members
添加调控关系
GetRegulators(
String)获取指定靶基因的所有上游TF
GetTargets(
String)获取指定TF的所有靶基因
ToWhitelist(
String())转换为白名单边列表（使用基因表达矩阵的索引）
GetAllGeneNames
获取所有涉及的基因名
Edges
调控关系列表
TFNames
所有转录因子名称
TargetNames
所有靶基因名称