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虚拟干扰分析引擎
BnInterventionAnalyzer
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.BNLearn.Intervention.BnInterventionAnalyzer
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| .ctor | 1 | 初始化 |
| AnalyzeIntervention | 1 | 执行单基因虚拟干扰分析 |
| DynamicIntervention | 1 | 动态级联模拟：模拟敲除后多个时间步的表达变化 每个时间步的输出作为下一个时间步的输入 |
| BatchIntervention | 1 | 批量干扰分析：对多个基因逐一进行敲除/过表达 |
| CreateUndefinedResult | 1 | 构建"找不到目标基因、未执行虚拟扰动"时的野生型降级结果： 干预后均值等于野生型均值，变化量/百分比全部为零、无任何显著变化基因， 并将结果对象 InterventionResult.Undefined 标记为 True。 |
| ComputeWildtypeMeans | 1 | 计算野生型基线表达值（从原始网络采样） |
| ComputeConditionalWildtypeMeans | 1 | 在给定外部观测证据（基因名 → 表达值）条件下计算野生型基线表达值。 仅采用与训练网络重叠的基因作为证据；键大小写不敏感。 用于在"用户真实样本表达水平"条件下求参考分布（观测证据模式）。 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Strict | 1 | Strict 严格模式开关（默认 True）。 True: 在拟合网络中匹配不到干预目标基因时，抛出 MissingMemberException 错误； False: 在终端打印一条警告消息，不执行虚拟扰动，直接以野生型数据作为扰动结果返回， 并将结果对象标记为未定义（InterventionResult.Undefined = True）。 |
04 Members
#ctor(BayesianNetwork, GeneExpressionData)
初始化
执行单基因虚拟干扰分析
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
evidence | InterventionSpec | 可选：观测证据（外部导入的转录组数据，基因名 → 表达值）。 若提供，则野生型基线将在"给定该表达水平条件"下计算， 使扰动结果反映用户真实样本背景下的因果效应（观测证据模式）。 键必须与 BayesianNetwork.Nodes 的 Name 对齐（大小写不敏感）。 仅与训练网络重叠的基因会被用作证据；空字典等价于不传入。 |
动态级联模拟：模拟敲除后多个时间步的表达变化 每个时间步的输出作为下一个时间步的输入
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
initialState | InterventionSpec | 可选：动态模拟的初始状态（按网络节点序的表达值向量）。 若提供（来自外部导入的转录组数据），则以此作为级联传播的起点， 模拟在用户样本背景下的动态传播（动态初始状态模式）。 长度需与网络节点数一致；为 Nothing 时使用训练数据均值作为起点（原有行为）。 |
批量干扰分析：对多个基因逐一进行敲除/过表达
CreateUndefinedResult(InterventionSpec,
Double())构建"找不到目标基因、未执行虚拟扰动"时的野生型降级结果： 干预后均值等于野生型均值，变化量/百分比全部为零、无任何显著变化基因， 并将结果对象 InterventionResult.Undefined 标记为 True。
ComputeWildtypeMeans(
Int32, Int32)计算野生型基线表达值（从原始网络采样）
ComputeConditionalWildtypeMeans(
Dictionary(Of String, Double), Int32, Int32)在给定外部观测证据（基因名 → 表达值）条件下计算野生型基线表达值。 仅采用与训练网络重叠的基因作为证据；键大小写不敏感。 用于在"用户真实样本表达水平"条件下求参考分布（观测证据模式）。
Strict
Strict 严格模式开关（默认 True）。 True: 在拟合网络中匹配不到干预目标基因时，抛出 MissingMemberException 错误； False: 在终端打印一条警告消息，不执行虚拟扰动，直接以野生型数据作为扰动结果返回， 并将结果对象标记为未定义（InterventionResult.Undefined = True）。