EdgeRelationType

Full name SMRUCC.genomics.Analysis.GEARS.Graph.EdgeRelationType Assembly SMRUCC.genomics.Analysis.GEARS Members 8

基因调控图中边的关系类型

00 Remarks

GEARS 将先验调控网络建模为异质图（heterogeneous graph），不同类型的调控关系在消息传递时使用不同的变换矩阵与符号，从而让模型能够学习到「激活边传递同向信号、抑制边传递反向信号」这样的生物学语义。

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Analysis.GEARS.Graph.EdgeRelationType

02 Fields

Name	Overloads	Summary
SelfLoop	2	自环边（节点保留自身信息）
Activation	2	激活/正向调控（TF 促进靶基因表达）
Repression	2	抑制/负向调控（TF 抑制靶基因表达）
CoExpression	2	共表达边（由 control 表达谱相关性推断，无方向信息）

03 Members

field SelfLoop #

SelfLoop

自环边（节点保留自身信息）

field Activation #

Activation

激活/正向调控（TF 促进靶基因表达）

field Repression #

Repression

抑制/负向调控（TF 抑制靶基因表达）

field CoExpression #

CoExpression

共表达边（由 control 表达谱相关性推断，无方向信息）

field SelfLoop overload 2 #

SelfLoop

field Activation overload 2 #

Activation

field Repression overload 2 #

Repression

field CoExpression overload 2 #

CoExpression