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TSSAR 的运行结果。
TssarResult
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.RNA_Seq.TSSAR.Models.TssarResult
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Chromosome | 1 | 参考序列名称。 |
| GenomeSize | 1 | 基因组长度。 |
| Tss | 1 | 全部被注释为 TSS 的位置（可能已经过聚类）。 |
| UnmodeledRegions | 1 | 无法用零膨胀 Poisson 回归建模、因而被排除出分析的基因组区间。 |
| TotalIndividualTss | 1 | 聚类之前的单个 TSS 数量。 |
| TotalClusteredTss | 1 | 聚类之后的 TSS 数量。 |
| UnmodeledLength | 1 | 未建模区域的总长度（nt）。 |
| UnmodeledRate | 1 | 未建模区域占基因组总长度的比例。 |
| PrimaryUtrLengths | 1 | Primary TSS 的 5'UTR 长度分布（仅当提供了基因注释时可用）。 |
| MeanTexEfficiency | 1 | 所有 TSS 的 TEX 处理效率平均值。 |
03 Members
Chromosome
参考序列名称。
GenomeSize
基因组长度。
Tss
全部被注释为 TSS 的位置（可能已经过聚类）。
UnmodeledRegions
无法用零膨胀 Poisson 回归建模、因而被排除出分析的基因组区间。
TotalIndividualTss
聚类之前的单个 TSS 数量。
TotalClusteredTss
聚类之后的 TSS 数量。
UnmodeledLength
未建模区域的总长度（nt）。
UnmodeledRate
未建模区域占基因组总长度的比例。
PrimaryUtrLengths
Primary TSS 的 5'UTR 长度分布（仅当提供了基因注释时可用）。
MeanTexEfficiency
所有 TSS 的 TEX 处理效率平均值。