nuget
操纵子中的基因在构造函数之中已经进行过按照转录方向排序操作了的
Operon
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Assembly.DOOR.Operon
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| GetLast | 1 | 依照Operon的方向，获取目标基因对象之后的所有基因 |
| IndexOf | 1 | 查看目标基因是否是本操纵子之中的结构基因 |
| ConvertToCsvData | 1 | 将目标Door操纵子对象转换为Csv格式的数据 |
| HaveGene | 1 | Has the gene with specific locusId in this operon? |
| ToString | 1 | |
| GetEnumerator | 1 | |
| TryGetValue | 1 | |
| GetEnumerator1 | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Key | 1 | OperonId value.(操纵子的Door编号) |
| OperonID | 1 | Door数据库之中的操纵子编号 |
| Value | 1 | Structure genes. (这个操纵子对象之中的结构基因，请注意Operon.Genes属性和这个属性一样，都是可以返回当前的这个Operon里面的所有的结构基因， 只不过本属性是没有经过排序的，而Operon.Genes属性里面的对象都是按照基因组上下文的顺序进行排序操作了的) |
| TestGuid | 1 | 在比较差异的时候，Operon编号没有意义，再这里使用操纵子内部的基因的编号的字符串来进行相互比较，基因号进行升序排序 |
| lstLocus | 1 | 这个Operon里面的所有的结构基因的基因号的集合 |
| InitialX | 1 | Get the operon initial structure (promoter) gene base on its transcript direction. |
| LastGene | 1 | 获取本操纵子对象之中的最后一个基因 |
| NumOfGenes | 1 | 这个操纵子里面的结构基因的数目 |
| Genes | 1 | 这个属性会返回本Operon里面的一组基因，基因的位置和其在基因组上面的位置相关，并且与链的方向相关 |
| Strand | 1 | |
| Item | 1 |
04 Fields
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| SortedIdList | 1 | 这个列表的对象顺序与KeyValuePairObject.Value之中的列表对象的顺序一致 |
05 Members
GetLast(
String)依照Operon的方向，获取目标基因对象之后的所有基因
Parameters
IndexOf(
String)查看目标基因是否是本操纵子之中的结构基因
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
GeneId | String | - |
ConvertToCsvData
将目标Door操纵子对象转换为Csv格式的数据
HaveGene(
String)Has the gene with specific locusId in this operon?
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
locusId | String | - |
Key
OperonId value.(操纵子的Door编号)
OperonID
Door数据库之中的操纵子编号
Value
Structure genes. (这个操纵子对象之中的结构基因，请注意Operon.Genes属性和这个属性一样，都是可以返回当前的这个Operon里面的所有的结构基因， 只不过本属性是没有经过排序的，而Operon.Genes属性里面的对象都是按照基因组上下文的顺序进行排序操作了的)
TestGuid
在比较差异的时候，Operon编号没有意义，再这里使用操纵子内部的基因的编号的字符串来进行相互比较，基因号进行升序排序
lstLocus
这个Operon里面的所有的结构基因的基因号的集合
InitialX
Get the operon initial structure (promoter) gene base on its transcript direction. (根据转录方向来选取目标操纵子的启动子基因，如果转录方向为正向，则取最前面的基因，反之取最后面的基因)
LastGene
获取本操纵子对象之中的最后一个基因
NumOfGenes
这个操纵子里面的结构基因的数目
Genes
这个属性会返回本Operon里面的一组基因，基因的位置和其在基因组上面的位置相关，并且与链的方向相关
SortedIdList
这个列表的对象顺序与KeyValuePairObject.Value之中的列表对象的顺序一致
Strand
Item
ToString()
GetEnumerator()
TryGetValue(
String, OperonGene)GetEnumerator1()