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The MetaCyc database file reader object. (MetaCyc数据库文件的读取对象)
PGDB
00 Remarks
DataFiles
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Assembly.MetaCyc.File.FileSystem.PGDB
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Add | 1 | Add the target element object into a specific table in a MetaCyc database object. |
| Save | 1 | 保存数据库，假若SavedDir参数不为空的话，则保存至SavedDir所指示的文件夹之内 |
| Load | 1 | (使用反射机制进行数据库数据的加载操作，根据条件编译来选择为并行加载还是串行加载) |
| PreLoad | 1 | 预加载MetaCyc数据库之中的部分数据 |
| ReflectionLoadMetaCyc | 1 | (使用反射机制进行数据库数据的加载操作) |
| ToString | 1 | |
| ParallelReadingMetaCyc | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| BindRxns | 1 | Binding reactions.(调控因子与DNA分子的结合反应) |
| Compounds | 1 | All of the chemical compounds and biomolecule that defines in this table. |
| Regulations | 1 | Regulation rule of the gene expression and enzyme activity.(对基因表达过程的调控以及酶活力的调节) |
| ProtLigandCplxes | 1 | (蛋白质分子和其他的组分结合所形成的蛋白质复合物) |
| Proteins | 1 | |
| WholeGenome | 1 | Get the whole genome sequence data for this species bacteria. |
| Reactions | 1 | |
| Pathways | 1 | |
| ProteinFeature | 1 | |
| Genes | 1 | |
| TransUnits | 1 | |
| DNABindingSites | 1 | |
| Promoters | 1 | |
| Terminators | 1 | |
| Enzrxns | 1 | |
| Species | 1 | |
| DataDIR | 1 |
04 Fields
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| AddingMethods | 1 | Adding methods for general object add to a specific data table in the metacyc database. |
05 Members
Add the target element object into a specific table in a MetaCyc database object. (将目标元素对象添加进入一个MetaCyc数据库中的一张指定的数据表之中)
Parameters
Save(
String)保存数据库，假若SavedDir参数不为空的话，则保存至SavedDir所指示的文件夹之内
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
EXPORT | String | 可选参数，目标MetaCyc数据库所要保存的文件夹位置 |
Load(
String)(使用反射机制进行数据库数据的加载操作，根据条件编译来选择为并行加载还是串行加载)
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
DIR | String | - |
PreLoad(
String, Boolean)预加载MetaCyc数据库之中的部分数据
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
DIR | String | 目标MetaCyc数据库的Data文件夹 |
ReflectionLoadMetaCyc(
String)(使用反射机制进行数据库数据的加载操作)
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
Dir | String | - |
BindRxns
Binding reactions.(调控因子与DNA分子的结合反应)
Compounds
All of the chemical compounds and biomolecule that defines in this table. (细胞中的所有的化学物质和生物分子组成)
Regulations
Regulation rule of the gene expression and enzyme activity.(对基因表达过程的调控以及酶活力的调节)
ProtLigandCplxes
(蛋白质分子和其他的组分结合所形成的蛋白质复合物)
Proteins
Remarks
在本处的蛋白质指的是具备有生物学活性的多肽链单体蛋白，而蛋白质复合物则指的是多个多肽链单体蛋白的 聚合物以及其与小分子化合物所形成的复合物
WholeGenome
Get the whole genome sequence data for this species bacteria.
AddingMethods
Adding methods for general object add to a specific data table in the metacyc database.
Reactions
Pathways
ProteinFeature
Genes
TransUnits
DNABindingSites
Promoters
Terminators
Enzrxns
Species
DataDIR
ToString()
ParallelReadingMetaCyc(
String)