Describes a UniProtKB entry. (因为entry.accessions可能会出现多个值,所以会需要使用 entry.ShadowCopy()函数来解决实体多态的问题。 经过shadow copy之后可以使用主键entry.accession来创建字典)
entry
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Assembly.Uniprot.XML.entry
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| ShadowCopy | 1 | 这个是处理有多个accession的情况 |
| ToString | 1 | |
| GetCommentText | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| accession | 1 | shadow copy之后的唯一标识符 |
| accessions | 1 | 蛋白质的唯一标识符,可以用作为字典的键名 |
| sequence | 1 | 当前的这个蛋白质的蛋白序列,在Uniprot数据库之中,蛋白记录只有蛋白序列 没有核酸序列,如果需要核酸序列,则会需要通过accession编号从nt库之中 提取出来 |
| dbReferences | 1 | Dictionary table can be read from entry.xrefs property |
| CommentList | 1 | indexed by comment.type |
| xrefs | 1 | entry.dbReferences table |
| dataset | 1 | |
| created | 1 | |
| modified | 1 | |
| version | 1 | |
| name | 1 | |
| protein | 1 | |
| features | 1 | |
| gene | 1 | |
| proteinExistence | 1 | |
| organism | 1 | |
| keywords | 1 | |
| comments | 1 | |
| references | 1 |
04 Members
ShadowCopy
这个是处理有多个accession的情况
accession
shadow copy之后的唯一标识符
accessions
蛋白质的唯一标识符,可以用作为字典的键名
sequence
当前的这个蛋白质的蛋白序列,在Uniprot数据库之中,蛋白记录只有蛋白序列 没有核酸序列,如果需要核酸序列,则会需要通过accession编号从nt库之中 提取出来
dbReferences
Dictionary table can be read from entry.xrefs property
CommentList
indexed by comment.type
xrefs
entry.dbReferences table
Remarks
indexed by the dbReference.type
dataset
created
modified
version
name
protein
features
gene
proteinExistence
organism
keywords
comments
references
ToString()
GetCommentText(
String)