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Network nodes
entry
00 Remarks
<entry>元素表示通路中的一个“节点”或“条目”，是构建代谢网络图的基本单元。每个<entry>都有一个唯一的ID（通过id属性指定）和一个或多个名称（通过name属性指定）， 以及该条目的类型（通过type属性指定）。根据type的不同，<entry>可以代表不同类型的生物学实体。
每个<entry>元素的核心作用是定义通路中的一个节点实体。例如，在糖酵解通路中，一个<entry>可以表示己糖激酶（基因/酶），另一个可以表示葡萄糖-6-磷酸（代谢物）。 节点之间通过<reaction>和<relation>元素连接，从而形成网络。
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Assembly.KEGG.WebServices.KGML.entry
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| id | 1 | 该条目的唯一标识符（在当前通路中唯一），是一个正整数。 |
| name | 1 | 该条目对应的KEGG数据库标识符，通常以“数据库:ID”的形式表示。例如，name="hsa:124"表示人类基因ID 124，name="cpd:C00031"表示化合物C00031（葡萄糖）。name属性可以包含多个值（多个基因或化合物），多个值之间用空格分隔。 |
| type | 1 | 条目的类型，如gene、compound等，用于标识该节点的生物学类别。entry的类别包括有： + gene：表示基因产物（通常是蛋白质），是代谢通路中的酶或其它蛋白质因子。 + enzyme：表示酶（有时与gene类似，但在参考通路中特指以EC编号表示的酶）。 + ortholog：表示直系同源群（以KO编号表示），在参考通路中代表一个保守的功… |
| link | 1 | 可选属性，提供该条目在KEGG数据库中的链接地址（例如基因或化合物的详情页面）。 |
| reaction | 1 | 可选属性，对于某些基因/酶类型的节点，可以指定其催化或参与的化学反应ID（例如reaction="rn:R00710"）。这通常用于酶节点，以表示该酶参与的反应。 |
| graphics | 1 | 一个或多个<graphics>子元素，用于描述该条目在官方通路图中的图形表示。 |
03 Members
id
该条目的唯一标识符（在当前通路中唯一），是一个正整数。
name
该条目对应的KEGG数据库标识符，通常以“数据库:ID”的形式表示。例如，name="hsa:124"表示人类基因ID 124，name="cpd:C00031"表示化合物C00031（葡萄糖）。name属性可以包含多个值（多个基因或化合物），多个值之间用空格分隔。
type
条目的类型，如gene、compound等，用于标识该节点的生物学类别。entry的类别包括有：
- gene：表示基因产物（通常是蛋白质），是代谢通路中的酶或其它蛋白质因子。
- enzyme：表示酶（有时与gene类似，但在参考通路中特指以EC编号表示的酶）。
- ortholog：表示直系同源群（以KO编号表示），在参考通路中代表一个保守的功能模块，可能在具体生物体中由一个或多个基因编码。
- compound：表示化学代谢物，是代谢反应的底物或产物。
- map：表示另一个通路的链接，相当于一个嵌套的子图节点（通常用于连接相关的通路图）。
- other：其它未分类的节点类型。
link
可选属性，提供该条目在KEGG数据库中的链接地址（例如基因或化合物的详情页面）。
reaction
可选属性，对于某些基因/酶类型的节点，可以指定其催化或参与的化学反应ID（例如reaction="rn:R00710"）。这通常用于酶节点，以表示该酶参与的反应。
graphics
一个或多个<graphics>子元素，用于描述该条目在官方通路图中的图形表示。