PGDB

Full name SMRUCC.genomics.Assembly.MetaCyc.File.FileSystem.PGDB Assembly SMRUCC.genomics.Core Members 12

The MetaCyc database file reader object. (MetaCyc数据库文件的读取对象)

00 Remarks

DataFiles

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Assembly.MetaCyc.File.FileSystem.PGDB

02 Methods

Name	Overloads	Summary
Add	1	Add the target element object into a specific table in a MetaCyc database object.
Save	1	保存数据库，假若SavedDir参数不为空的话，则保存至SavedDir所指示的文件夹之内
Load	1	(使用反射机制进行数据库数据的加载操作，根据条件编译来选择为并行加载还是串行加载)
PreLoad	1	预加载MetaCyc数据库之中的部分数据
ReflectionLoadMetaCyc	1	(使用反射机制进行数据库数据的加载操作)

03 Properties

Name	Overloads	Summary
BindRxns	1	Binding reactions.(调控因子与DNA分子的结合反应)
Compounds	1	All of the chemical compounds and biomolecule that defines in this table.
Regulations	1	Regulation rule of the gene expression and enzyme activity.(对基因表达过程的调控以及酶活力的调节)
ProtLigandCplxes	1	(蛋白质分子和其他的组分结合所形成的蛋白质复合物)
Proteins	1
WholeGenome	1	Get the whole genome sequence data for this species bacteria.

04 Fields

Name	Overloads	Summary
AddingMethods	1	Adding methods for general object add to a specific data table in the metacyc database.

05 Members

method Add #

Add(PGDB, Object)

Add the target element object into a specific table in a MetaCyc database object. (将目标元素对象添加进入一个MetaCyc数据库中的一张指定的数据表之中)

Parameters

Name	Type	Description
`MetaCyc`	PGDB	-
`e`	Object	-

method Save #

Save(String)

保存数据库，假若SavedDir参数不为空的话，则保存至SavedDir所指示的文件夹之内

Parameters

Name	Type	Description
`EXPORT`	`String`	可选参数，目标MetaCyc数据库所要保存的文件夹位置

method Load #

Load(String)

(使用反射机制进行数据库数据的加载操作，根据条件编译来选择为并行加载还是串行加载)

Parameters

Name	Type	Description
`DIR`	`String`	-

method PreLoad #

PreLoad(String, Boolean)

预加载MetaCyc数据库之中的部分数据

Parameters

Name	Type	Description
`DIR`	`String`	目标MetaCyc数据库的Data文件夹

method ReflectionLoadMetaCyc #

ReflectionLoadMetaCyc(String)

(使用反射机制进行数据库数据的加载操作)

Parameters

Name	Type	Description
`Dir`	`String`	-

property BindRxns #

BindRxns

Binding reactions.(调控因子与DNA分子的结合反应)

property Compounds #

Compounds

All of the chemical compounds and biomolecule that defines in this table. (细胞中的所有的化学物质和生物分子组成)

property Regulations #

Regulations

Regulation rule of the gene expression and enzyme activity.(对基因表达过程的调控以及酶活力的调节)

property ProtLigandCplxes #

ProtLigandCplxes

(蛋白质分子和其他的组分结合所形成的蛋白质复合物)

property Proteins #

Proteins

Remarks

在本处的蛋白质指的是具备有生物学活性的多肽链单体蛋白，而蛋白质复合物则指的是多个多肽链单体蛋白的聚合物以及其与小分子化合物所形成的复合物

property WholeGenome #

WholeGenome

Get the whole genome sequence data for this species bacteria.

field AddingMethods #

AddingMethods

Adding methods for general object add to a specific data table in the metacyc database.