使用一个汇总的MetaCyc数据库,根据目标物种的基因组以及蛋白质信息进行MetaCyc数据库的重建工作
PathwayMappingTool
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Assembly.MetaCyc.Schema.Metabolism.PathwayMappingTool
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| .ctor | 1 | 用于进行参考的MetaCyc数据库 |
| DownloadFromUniprot | 1 | |
| Initlaize | 1 |
03 Members
#ctor(DatabaseLoadder)
用于进行参考的MetaCyc数据库
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
MetaCyc | DatabaseLoadder | - |
DownloadFromUniprot(Proteins,
String)Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
Proteins | Proteins | - |
SavedFile | String | - |
Returns
返回序列下载结果,当所有的序列结果都下载完成的时候,返回0,当出现没有被下载的序列的情况时,返回未被下载的序列数
Initlaize()