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OrganismModel
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Data.OrganismModel
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| GetGenbankSource | 1 | Get NCBI genbank reference sequence assembly name |
| CreateModel | 1 | 从KEGG的代谢途径下载文件夹加载零散的文件数据构成这个整体数据模型 |
| EnumerateModules | 1 | 这个函数会自动判断数据的来源进行加载 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| genome | 1 | 基因组是由代谢途径功能模块所构成的 |
| KoFunction | 1 | [geneID => KO] maps |
04 Members
GetGenbankSource
Get NCBI genbank reference sequence assembly name
CreateModel(
String)从KEGG的代谢途径下载文件夹加载零散的文件数据构成这个整体数据模型
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
handle | String | - |
EnumerateModules(
String)这个函数会自动判断数据的来源进行加载
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
handle | String | 可以同时兼容OrganismModel或者 |
genome
基因组是由代谢途径功能模块所构成的
KoFunction
[geneID => KO] maps