The sandbox engine output raw data file format
CellularModules
01 Syntax
SMRUCC.genomics.GCModeller.ModellingEngine.IO.Raw.CellularModules
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| mRNAId | 1 | 由基因转录出来的mRNA的编号列表 |
| RNAId | 1 | 由基因转录出来的其他的RNA分子的编号列表 |
| Polypeptide | 1 | 由mRNA翻译出来的多肽链的Id列表 |
| Proteins | 1 | 由一条或者多条多肽链修饰之后得到的最终的蛋白质的编号列表 |
| Metabolites | 1 | 代谢物列表 |
| Reactions | 1 | 反应过程编号列表 |
03 Fields
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Magic | 1 |
04 Members
mRNAId
由基因转录出来的mRNA的编号列表
Remarks
ORF gene id
RNAId
由基因转录出来的其他的RNA分子的编号列表
Remarks
RNA gene id
Polypeptide
由mRNA翻译出来的多肽链的Id列表
Remarks
Usually is the Uniprot protein id
Proteins
由一条或者多条多肽链修饰之后得到的最终的蛋白质的编号列表
Remarks
Protein complexe
Metabolites
代谢物列表
Remarks
Usually is the KEGG compounds
Reactions
反应过程编号列表
Remarks
Usually is the KEGG reactions
Magic