MotifSite

Full name SMRUCC.genomics.Interops.NBCR.MEME_Suite.ComponentModel.MotifSite Assembly SMRUCC.genomics.Interops.NBCR.MEME_Suite.Documents Members 6

Motif的Csv文件输出格式之1

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Interops.NBCR.MEME_Suite.ComponentModel.MotifSite

02 Properties

Name	Overloads	Summary
Locus_tag	1	位点名称，通常为基因号
RightEndDownStream	1	从右端往前数的MotifSite.Start的位置，假若这条序列是表示启动子区的序列的话，并且从ATG上游开始取序列至ATG位点，则这个属性值还可以作为ATGDistance
gStart	1	位点在基因组序列上面的左端起始
gStop	1	位点在基因组序列上面的右端结束
Strand	1	位点在链上面的方向
Tag	1	一些其他的用户的自定义的数据

03 Members

property Locus_tag #

Locus_tag

位点名称，通常为基因号

property RightEndDownStream #

RightEndDownStream

从右端往前数的MotifSite.Start的位置，假若这条序列是表示启动子区的序列的话，并且从ATG上游开始取序列至ATG位点，则这个属性值还可以作为ATGDistance

property gStart #

gStart

位点在基因组序列上面的左端起始

property gStop #

gStop

位点在基因组序列上面的右端结束

property Strand #

Strand

位点在链上面的方向

property Tag #

Tag

一些其他的用户的自定义的数据