MemeWriter
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Interops.NBCR.MEME_Suite.MemeWriter
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| WriteMemeFormat | 3 | 将PWM模型保存为MEME格式的文本文件 |
| WriteDocument | 1 |
03 Members
WriteMemeFormat(
IEnumerable(Of Probability), String, Dictionary(Of String, Double), Int32, String)将PWM模型保存为MEME格式的文本文件
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
motifs | IEnumerable(Of Probability) | PWM模型对象集合 |
outputPath | String | 输出文件路径 |
backgroundFreq | Dictionary(Of String, Double) | 背景碱基频率(可选) |
nsites | Int32 | 位点数量(可选,默认为100) |
url | String | URL链接(可选) |
WriteMemeFormat(
Probability, String, Dictionary(Of String, Double), Int32, String)将PWM模型保存为MEME格式的文本文件
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
motif | Probability | PWM模型对象 |
outputPath | String | 输出文件路径 |
backgroundFreq | Dictionary(Of String, Double) | 背景碱基频率(可选) |
nsites | Int32 | 位点数量(可选,默认为100) |
url | String | URL链接(可选) |
WriteMemeFormat(
Probability, String)重载方法:使用默认参数保存
WriteDocument(
TextWriter)