Levels

Full name SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.Application.BBH.Levels Assembly SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions Members 8

The blast result alignment identify levels

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.Application.BBH.Levels

02 Fields

Name	Overloads	Summary
NA	2	A和B之间没有同源性
BBH	2	A vs B 以及 B vs A 都是得分最高的(BHR = 1)
BHR	2	A vs B 以及 B vs A 都不是得分最高的,但是BHR得分是最高的 (BHR >= threshold)
SBH	2	只有一个方向的比对结果是最高的

03 Members

field NA #

A和B之间没有同源性

field BBH #

BBH

A vs B 以及 B vs A 都是得分最高的(BHR = 1)

field BHR #

BHR

A vs B 以及 B vs A 都不是得分最高的,但是BHR得分是最高的 (BHR >= threshold)

field SBH #

SBH

只有一个方向的比对结果是最高的

field NA overload 2 #

field BBH overload 2 #

BBH

field BHR overload 2 #

BHR

field SBH overload 2 #

SBH