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API Docs / SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions / IBlastOutput

IBlastOutput

Full name SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.BLASTOutput.IBlastOutput Assembly SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions Members 6

Blast程序结果对外输出的统一接口类型对象

00 Remarks

Reader文件夹之下为各种格式的日志文件的读取类对象 对于BLAST日志文件，则有一个BlastLogFile对象作为对外保存和其他程序读取的统一接口

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.BLASTOutput.IBlastOutput

02 Methods

NameOverloadsSummary
ExportBestHit 1 仅导出每条记录的第一个最佳匹配的结果
ExportAllBestHist 1 导出每条记录中的所有最佳的匹配结果
Grep 1

03 Properties

NameOverloadsSummary
FilePath 1
Database 1

04 Fields

NameOverloadsSummary
HITS_NOT_FOUND 1

05 Members

method ExportBestHit #
ExportBestHit(Double, Double)

仅导出每条记录的第一个最佳匹配的结果

method ExportAllBestHist #
ExportAllBestHist(Double, Double)

导出每条记录中的所有最佳的匹配结果

field HITS_NOT_FOUND #
HITS_NOT_FOUND
property FilePath #
FilePath
property Database #
Database
method Grep #
Grep(TextGrepMethod, TextGrepMethod)