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从NCBI网站之中下载的比对结果的表格文本文件之中进行数据的解析操作
HitTableParser
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.NCBIBlastResult.WebBlast.HitTableParser
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| IterateTables | 1 | 当文件之中包含有多个表的时候使用 |
| LoadTable | 1 | 适用于一个文件只有一个表的时候 |
| Mapper | 1 | Document line parser |
03 Members
IterateTables(
String, Boolean)当文件之中包含有多个表的时候使用
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
path$ | String | - |
LoadTable(
String, Boolean)适用于一个文件只有一个表的时候
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
path | String | 使用NCBI的web blast的结果输出表的默认格式的文件 |
headerSplit | Boolean | 当HitRecord.SubjectIDs之中包含有多个比对结果序列的时候，是否使用分号 |
Mapper(
String, Index(Of String))Document line parser
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
s | String | - |