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在做motif的分布密度的时候，将每一种类型的motif看作为一个等位基因
Gendist
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Interops.Visualize.Phylip.MatrixFile.Gendist
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| GenerateDocument | 1 | 主要是生成没有设置有A选项的文件数据 |
| LoadDocument | 1 | 加载已经生成的gendist矩阵文件之中的数据 |
| SubMatrix | 1 | 采集至少Count数量的和MainIndex相近的基因组 |
| CreateMotifDistrMAT | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| SpeciesCount | 1 | 基因组的数目 |
| NumberOfLoci | 1 | motif的数目 |
| NumberOfAlleles | 1 | There then follows a line which gives the numbers of alleles at each locus, in order. |
04 Members
GenerateDocument
主要是生成没有设置有A选项的文件数据
LoadDocument(
String)加载已经生成的gendist矩阵文件之中的数据
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
Path | String | - |
SubMatrix(
Int32, String)采集至少Count数量的和MainIndex相近的基因组
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
Count | Int32 | - |
MainIndex | String | - |
SpeciesCount
基因组的数目
NumberOfLoci
motif的数目
NumberOfAlleles
There then follows a line which gives the numbers of alleles at each locus, in order. This must be the full number of alleles, not the number of alleles which will be input: i. e. for a two-allele locus the number should be 2, not 1.
CreateMotifDistrMAT(
File)