假若直接根据KO对应的Reaction进行网络的装配的话,可能会造成生成的网络非常的密集的现象出现 因为一个reaction发生的基础是存在必须要有相应的代谢物和酶的存在 所以在这个模块之中会尝试依据代谢物是否缺失来判断某一个反应网络之中的边是否存在
CompoundSupportsEvidence
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Model.Network.KEGG.CompoundSupportsEvidence
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| EvidenceScore | 1 |
03 Members
EvidenceScore(
ReactionRepository, String, Index(Of String), Int32)Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
repo | ReactionRepository | 所有的代谢反应过程的标准参考数据的集合 |
background | String | 目标基因组的KO注释结果的编号集合 |
rxnId | Index(Of String) | 需要进行计算判断的目标代谢反应过程 |