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简单描述调控位点和调控因子之间的关系以及该位点在基因组上面的位置
RegulatesFootprints
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Model.Network.VirtualFootprint.DocumentFormat.RegulatesFootprints
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| TraceUid | 1 | 非严格的 |
| TraceUidStrict | 1 | 严格的 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| regulator | 1 | 这个基因对象所被预测的调控因子 |
| cor | 1 | 所预测的调控因子对目标基因的调控作用的权重的大小，这里的元素的顺序是和RegulatesFootprints.regulator之中的顺序是一一对应的 |
| WGCNA | 1 | the WGCNA module type of this regulated ORF gene |
| type | 1 | annotation type |
| class | 1 | A 目标基因对象的KEGG的代谢途径分类 |
| subclass | 1 | B 目标基因对象的KEGG的代谢途径分类 |
| regulator_trace | 1 | source trace of the TF regulator. |
| motif_trace | 1 | source trace of the TFBS site motif. |
| tag | 1 | 自定义的一个标签数据 |
04 Members
TraceUid(RegulatesFootprints)
非严格的
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
x | RegulatesFootprints | - |
TraceUidStrict(RegulatesFootprints)
严格的
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
x | RegulatesFootprints | - |
regulator
这个基因对象所被预测的调控因子
cor
所预测的调控因子对目标基因的调控作用的权重的大小，这里的元素的顺序是和RegulatesFootprints.regulator之中的顺序是一一对应的
Returns
the correlation value which is evaluated from the expression value of target gene and target regulator
WGCNA
the WGCNA module type of this regulated ORF gene
type
annotation type
class
A 目标基因对象的KEGG的代谢途径分类
subclass
B 目标基因对象的KEGG的代谢途径分类
regulator_trace
source trace of the TF regulator.
Remarks
(调控因子的匹配来源)
motif_trace
source trace of the TFBS site motif.
Remarks
(Motif的匹配来源)
tag
自定义的一个标签数据