Integrator

Full name SMRUCC.genomics.Model.OperonMapper.OperonPredictor.Core.Integrator Assembly SMRUCC.genomics.Model.OperonMapper Members 4

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Model.OperonMapper.OperonPredictor.Core.Integrator

02 Methods

Name	Overloads	Summary
ScorePair	1	计算单对全部信号 LLR 与联合 log-odds
RunHmm	1	对同链对序列（连续 run）跑 HMM：Viterbi + 前向后向。返回每对 Viterbi 状态（True=同操纵子）与 FB 后验（就地写入）。
Sigmoid	1
Logit	1

03 Members

method ScorePair #

ScorePair(PairSignals, Double, IntegrationOptions)

计算单对全部信号 LLR 与联合 log-odds

method RunHmm #

RunHmm(List(Of List(Of PairSignals)), Double, IntegrationOptions)

对同链对序列（连续 run）跑 HMM：Viterbi + 前向后向。返回每对 Viterbi 状态（True=同操纵子）与 FB 后验（就地写入）。

method Sigmoid #

Sigmoid(Double)

method Logit #

Logit(Double)