Figure 1 Identification of transcription start sites (TSS) in the S. meliloti genome: 依据最小转录单元(MTU)模型将 TSS 分为六类。

(i) TSS Of an mRNA (mTSS)：ATG 上游 54 nt 区域内（本实现取 0–300 bp） 覆盖的显著 5' 端；54 nt 是能包含启动子 motif 与核糖体结合位点的最小长度。 (ii) TSS Of a leaderless transcript (lmTSS)：与翻译起始密码子第一位重叠。 (iii) TSS Of a putative mRNA (pmTSS)：难以区分是长 5'UTR 的 mRNA 还是 trans-encoded sRNA。 (iv) TSS of a sense transcript (seTSS)：位于蛋白编码基因内部且与其同向。 (v) TSS of a cis-encoded antisense RNA (asTSS)：与蛋白编码目标基因反向。 (vi) TSS of a trans-encoded sRNA (sTSS)：位于基因间区且与相邻基因有确定距离。