生成可供基因组浏览器(IGV 等)加载的 WIG 轨道文件。
WigWriter
01 Syntax
SMRUCC.genomics.SequenceModel.RNA_Seq.Rockhopper.FileIO.WigWriter
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| WriteUTRs | 1 | 输出预测 UTR(5'/3' UTR)的 WIG 轨道:正链记 +1,负链记 -1。 |
| WriteRNAs | 1 | 输出预测新 RNA(ncRNA / sRNA)的 WIG 轨道。 |
| WriteDifferentiallyExpressedGenes | 1 | 输出差异表达基因的 WIG 轨道(数值为 -log10(q-value),负链取负)。 |
| writeTrack | 1 | 写出 fixedStep WIG 轨道。 |
03 Members
WriteUTRs(
String, String, List(Of Gene), Int32)输出预测 UTR(5'/3' UTR)的 WIG 轨道:正链记 +1,负链记 -1。
WriteRNAs(
String, String, List(Of Gene), Int32)输出预测新 RNA(ncRNA / sRNA)的 WIG 轨道。
WriteDifferentiallyExpressedGenes(
String, String, List(Of Gene), Int32)输出差异表达基因的 WIG 轨道(数值为 -log10(q-value),负链取负)。
writeTrack(
String, String, String, Int32(), String)写出 fixedStep WIG 轨道。