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一个基因在两个实验条件之间 TSS/TTS 的差异。
TSSsDifferent
01 Syntax
SMRUCC.genomics.SequenceModel.RNA_Seq.Rockhopper.Regulation.TSSsDifferent
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| TSSChanged | 1 | TSS 是否发生变化（|Δ| > 10 bp）。 |
| TTSChanged | 1 | TTS 是否发生变化（|Δ| > 10 bp）。 |
| ToString | 1 | |
| HaveBoth | 1 | |
| HaveTSSs | 1 | |
| HaveTTSs | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| GeneID | 1 | 基因号 / locus_tag。 |
| TSSs_Condition1 | 1 | 条件 1 中的转录起始位点。 |
| TSSs_Condition2 | 1 | 条件 2 中的转录起始位点。 |
| TTSs_Condition1 | 1 | 条件 1 中的转录终止位点。 |
| TTSs_Condition2 | 1 | 条件 2 中的转录终止位点。 |
| Condition1 | 1 | 产生差异的两个实验条件的名称。 |
| Condition2 | 1 | 产生差异的两个实验条件的名称。 |
| Pathway | 1 | 该基因参与的 KEGG 通路。 |
04 Members
TSSChanged
TSS 是否发生变化（|Δ| > 10 bp）。
TTSChanged
TTS 是否发生变化（|Δ| > 10 bp）。
GeneID
基因号 / locus_tag。
TSSs_Condition1
条件 1 中的转录起始位点。
TSSs_Condition2
条件 2 中的转录起始位点。
TTSs_Condition1
条件 1 中的转录终止位点。
TTSs_Condition2
条件 2 中的转录终止位点。
Condition1
产生差异的两个实验条件的名称。
Condition2
产生差异的两个实验条件的名称。
Pathway
该基因参与的 KEGG 通路。
ToString()
HaveBoth()
HaveTSSs()
HaveTTSs()