SMRUCC.genomics.Visualize.ChromosomeMap 1.0.9753.40023.

Namespaces 7 Types 22 Members 131

01 Namespaces

SMRUCC.genomics.Visualize.ChromosomeMap

Type	Summary	Members
ChromesomeMapAPI	This module contains the required API function for create the chromosomes map of a specific bacteria genome.	9
DrawingDevice		11
PlasmidAnnotation		6
RegionMap	Draw a map of the selected region	1

SMRUCC.genomics.Visualize.ChromosomeMap.Configuration

Type	Summary	Members
Config	配置数据的文本文件模型，保存或者读取配置数据，请使用本对象类型来执行	30
DataReader	配置数据的数据模型，请使用Config.ToConfigurationModel()方法来初始化本数据模型对象，真正所被使用到的内存之中的配置文件的对象模型	20
Extensions		4

SMRUCC.genomics.Visualize.ChromosomeMap.DrawingDevice

Type	Summary	Members
args	因为调用函数DrawingDevice.drawingImpl())还需要根据DrawingDevice.chrMapDrawerProcessor())的处理情况来判断结束条件	0

SMRUCC.genomics.Visualize.ChromosomeMap.DrawingModels

Type	Summary	Members
ChromesomeDrawingModel	Data model for described a chromosome drawing action invoked.(用于描述如何绘制一个基因组的图形数据的数据模型)	7
LabelPaddingExtensions		2
Loci	长方形	5
ModelColorExtensions		1
MotifSite	Motif位点	5
MultationPointData	基因组上面的突变位点的绘图数据	5
MutationTypes	突变的类型	7
SegmentObject	染色体上面的一个基因的绘图模型	4
Site	基因组之中的一个位点	7
TextPadding		3
TSSs		2

SMRUCC.genomics.Visualize.ChromosomeMap.FootprintMap

Type	Summary	Members
RegulationMotifSite	Drawing model and method for the footprint motifs.	1

SMRUCC.genomics.Visualize.ChromosomeMap.PlasmidMap

Type	Summary	Members
PlasmidMapDrawingModel	全基因组图谱的绘制是线性的，而plasmid图谱则是圆环状的	0

SMRUCC.genomics.Visualize.ChromosomeMap.PlasmidMap.DrawingModels

Type	Summary	Members
DrawGene		1