nuget
使用highlights来标记基因组之中的基因
GeneMark
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Visualize.Circos.TrackDatas.Highlights.GeneMark
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| .ctor | 4 | 假若使用这个构造函数的话，这个需要手工初始化TrackDataDocument.source和GeneMark.COGColors |
| LegendsDrawing | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| COGColors | 1 |
04 Members
#ctor(
IEnumerable(Of IGeneBrief), Dictionary(Of String, String), String)在这里是使用直方图来显示基因的位置的
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
annos | IEnumerable(Of IGeneBrief) | - |
COG_colors | Dictionary(Of String, String) | - |
#ctor(
IEnumerable(Of IMotifSite), Dictionary(Of String, String), String)直接从motif位点构建，这个模型并不显示标签信息 使用Highlight生成track数据
Dim track As New Highlight(New GeneMark(genes, colors))Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
sites | IEnumerable(Of IMotifSite) | - |
color | Dictionary(Of String, String) | - |
#ctor(
IEnumerable(Of IMotifSite), String, String)Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
sites | IEnumerable(Of IMotifSite) | - |
colors$ | String | The color theme name |
chr$ | String | - |
#ctor
假若使用这个构造函数的话，这个需要手工初始化TrackDataDocument.source和GeneMark.COGColors
COGColors
LegendsDrawing(
Point, IGraphics)