circos 文档对象到圆环几何(角度/半径)的映射。
负责:
- 按染色体的长度与
ideogram.spacing分配角度区间 - 处理单染色体模型之中的
loopHole缺口 - 将基因组坐标映射为角度
circos 文档对象到圆环几何(角度/半径)的映射。
负责:
ideogram.spacing 分配角度区间loopHole 缺口01 Syntax
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| AngleOf | 1 | 将基因组坐标映射为角度(度,0 = 正上方,顺时针) |
| AngleRangeOf | 1 | 计算一个基因组区段(start..end)所对应的角度区间 |
| parseChromosomes | 1 | 解析 chromosomes 选择子。当 chromosomes_display_default 为 yes 的时候返回 Nothing(表示全部显示) |
| TryGetBand | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| ImageRadius | 1 | 图像半径(像素) |
| Bands | 1 | 参与绘制的染色体(按照它们在 karyotype 文件之中的顺序) |
| GenomeSize | 1 | 所有染色体有效长度的总和(nt) |
| SpacingAngle | 1 | 染色体之间的角度间距(度) |
| IsEmpty | 1 | 是否成功的解析出了染色体骨架信息 |
04 Members
Int32)将基因组坐标映射为角度(度,0 = 正上方,顺时针)
计算一个基因组区段(start..end)所对应的角度区间
解析 chromosomes 选择子。当 chromosomes_display_default 为 yes 的时候返回 Nothing(表示全部显示)
图像半径(像素)
参与绘制的染色体(按照它们在 karyotype 文件之中的顺序)
所有染色体有效长度的总和(nt)
染色体之间的角度间距(度)
是否成功的解析出了染色体骨架信息
String, ChromosomeBand)