SyntenyRegionExtensions

Full name SMRUCC.genomics.Visualize.SyntenyVisualize.SyntenyRegionExtensions Assembly SMRUCC.genomics.Visualize.SyntenyVisualize Members 1

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Visualize.SyntenyVisualize.SyntenyRegionExtensions

02 Methods

Name	Overloads	Summary
PopulateRegions	1	在这里会使用SmithWater-Man算法将blastn独立的基因比对结果链接为更加宽泛的同源区域

03 Members

method PopulateRegions #

PopulateRegions``1(IEnumerable(Of ``0), Double, ValueTuple(Of Int32, Int32))

在这里会使用SmithWater-Man算法将blastn独立的基因比对结果链接为更加宽泛的同源区域

Remarks

如果基因组很大的话，这个函数的工作效率会非常低，这个函数只适合生成小基因组之间的绘图模型

Parameters

Name	Type	Description
`maps`	IEnumerable(Of ``0)	-
`cutoff`	`Double`	[0, 1]