nuget
算法比较评估模块
MetagenomicsBenchmark
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.Metagenome.MetagenomicsBenchmark
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| .ctor | 1 | |
| RunBenchmark | 1 | 执行所有工具的比较并生成排名 |
| EvaluateTool | 1 | 评估单个工具相对于参考数据的表现 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| tool_name | 1 |
04 Members
#ctor(
IEnumerable(Of OTUTable), IEnumerable(Of OTUTable), Dictionary(Of String, OTUTable()), Dictionary(Of String, String()))Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
reference | IEnumerable(Of OTUTable) | 参考真值数据 |
tool_new | IEnumerable(Of OTUTable) | 新算法结果 |
current_tools | Dictionary(Of String, OTUTable()) | 现有算法字典 |
groups | Dictionary(Of String, String()) | 样本分组信息 |
RunBenchmark
执行所有工具的比较并生成排名
Returns
按综合得分降序排列的得分列表
EvaluateTool(
String, OTUTable())评估单个工具相对于参考数据的表现
tool_name