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用于存储 --output 文件中每一行的数据，这个文件详细列出了每一条序列（read）的分类结果。每一行对应一条 read。
KrakenOutputRecord
00 Remarks
--output 文件是 read-centric 的，关注点是“每一条 read 被分到了哪里”。
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.Metagenome.Kmers.Kraken2.KrakenOutputRecord
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| GetKMerMapping | 1 | |
| MakeAnnotationResult | 1 | |
| ParseDocument | 1 | |
| Save | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| StatusCode | 1 | "C" or "U" C: Classified (已分类)。表示 Kraken2 成功为该 read 分配了一个分类单元。 U: Unclassified (未分类)。表示该 read 未能被分配到任何数据库中的分类单元。 |
| ReadName | 1 | 输入的 FASTQ 文件中该 read 的序列标识符。 |
| TaxID | 1 | 这是 Kraken2 最终分配给该 read 的分类单元的 NCBI Taxonomy ID。这个分类单元是该 read 上所有 k-mer 的最低共同祖先。 |
| Taxonomy | 1 | biom style taxonomy string |
| ReadLength | 1 | 该 read 的碱基数量。 |
| LcaMappings | 1 | LCA映射详情, 使用字典来存储 k-mer 的分配详情，键是 TaxID，值是 k-mer 数量 这是一个由空格分隔的列表，详细描述了该 read 中所有 k-mer 的分配情况。 格式为 [TaxID]:[k-mer数量]。 0 是一个特殊的 TaxID，通常代表未分类的 k-mer（即数据库中没有匹配的 k-mer）。0:6 表示有 6 个… |
| LCASupport | 1 | |
| LCATaxids | 1 |
04 Members
StatusCode
"C" or "U"
C: Classified (已分类)。表示 Kraken2 成功为该 read 分配了一个分类单元。 U: Unclassified (未分类)。表示该 read 未能被分配到任何数据库中的分类单元。
ReadName
输入的 FASTQ 文件中该 read 的序列标识符。
TaxID
这是 Kraken2 最终分配给该 read 的分类单元的 NCBI Taxonomy ID。这个分类单元是该 read 上所有 k-mer 的最低共同祖先。
Taxonomy
biom style taxonomy string
ReadLength
该 read 的碱基数量。
LcaMappings
LCA映射详情, 使用字典来存储 k-mer 的分配详情，键是 TaxID，值是 k-mer 数量
这是一个由空格分隔的列表，详细描述了该 read 中所有 k-mer 的分配情况。 格式为 [TaxID]:[k-mer数量]。 0 是一个特殊的 TaxID，通常代表未分类的 k-mer（即数据库中没有匹配的 k-mer）。0:6 表示有 6 个 k-mer 未被分类。
LCASupport
LCATaxids
GetKMerMapping(
String)MakeAnnotationResult(
IEnumerable(Of KrakenOutputRecord))ParseDocument(
String)Save(
IEnumerable(Of KrakenOutputRecord), Stream)