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双库（[+] / [-]）双链的逐位置 read 起始覆盖度。
CoverageMap
00 Remarks
四个覆盖度向量的命名与原始 TSSAR Perl/R 脚本保持一致：
- CoverageMap.PlusPlus = library_P_1（[+] 库、正链）
- CoverageMap.PlusMinus = library_P_0（[+] 库、负链）
- CoverageMap.MinusPlus = library_M_1（[-] 库、正链）
- CoverageMap.MinusMinus = library_M_0（[-] 库、负链）
所有数组长度为 genomeSize + 1，下标 1..genomeSize 有效。
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.RNA_Seq.TSSAR.CoverageMap
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| MaxPosition | 1 | 所有 read 之中到达的最远位置。 |
| SumPlus | 1 | [+] 库的全部 read 起始总数。 |
| SumMinus | 1 | [-] 库的全部 read 起始总数。 |
| NormalizePlus | 1 | 把较大的 [+] 文库缩放到较小文库规模所用的归一化因子。 |
| NormalizeMinus | 1 | 把较大的 [-] 文库缩放到较小文库规模所用的归一化因子。 |
| GenomeSize | 1 | |
| PlusPlus | 1 | |
| PlusMinus | 1 | |
| MinusPlus | 1 | |
| MinusMinus | 1 |
03 Members
MaxPosition
所有 read 之中到达的最远位置。
SumPlus
[+] 库的全部 read 起始总数。
SumMinus
[-] 库的全部 read 起始总数。
NormalizePlus
把较大的 [+] 文库缩放到较小文库规模所用的归一化因子。
NormalizeMinus
把较大的 [-] 文库缩放到较小文库规模所用的归一化因子。
GenomeSize
PlusPlus
PlusMinus
MinusPlus
MinusMinus