ZipRegression

Full name SMRUCC.genomics.Analysis.RNA_Seq.TSSAR.Statistics.ZipRegression Assembly SMRUCC.genomics.Analysis.RNA-Seq.TSSAR Members 3

截距型零膨胀 Poisson 模型的最大似然参数估计。

00 Remarks

原始 TSSAR 的 R 实现使用 VGAM::vglm(y1 ~ x2, zapoisson(zero = 1))，其中回归元 x2 = runif(n) 是纯随机噪声，其回归系数约等于 0。因此该模型在数学上等价于截距型（常数参数）的 ZIP 模型，本模块直接使用 EM 算法对该 2 参数模型做极大似然估计，避免了对外部 VGAM/R 运行时的依赖，并且更快、结果可控。

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Analysis.RNA_Seq.TSSAR.Statistics.ZipRegression

02 Methods

Name	Overloads	Summary
Density	1	计算零膨胀 Poisson 分布的概率质量函数 dzipois(x, lambda, pstr0)。
Fit	2	对给定样本执行截距型 ZIP 模型的 EM 最大似然估计（指定有效长度）。

03 Members

method Density #

Density(Double, Double, Double)

计算零膨胀 Poisson 分布的概率质量函数 dzipois(x, lambda, pstr0)。

method Fit overload 2 #

Fit(Double())

对给定样本执行截距型 ZIP 模型的 EM 最大似然估计。

Parameters

Name	Type	Description
`y`	`Double()`	窗口内的观测计数。

Returns

估计结果；ZipEstimate.Converged 为 False 表示不可建模。

method Fit #

Fit(Double(), Int32)

对给定样本执行截距型 ZIP 模型的 EM 最大似然估计（指定有效长度）。

Parameters

Name	Type	Description
`y`	`Double()`	观测计数缓冲区。
`n`	`Int32`	有效元素个数，用于复用缓冲区以避免频繁分配。

Returns

估计结果；ZipEstimate.Converged 为 False 表示不可建模。