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模糊相等的
MirrorPalindrome
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.SequencePatterns.Topologically.SimilarityMatches.MirrorPalindrome
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| haveMirror | 1 | 判断目标序列sequence上面是否包含有目标种子位点的镜像位点 |
| CreateMirrors | 1 |
03 Members
haveMirror(
Int32, Int32, String, String, Double, Int32)判断目标序列sequence上面是否包含有目标种子位点的镜像位点
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
l | Int32 | 目标片段的长度 |
loci | Int32 | 位点的位置 |
mirror | String | 进行模糊比较的参考序列 |
sequence | String | 基因组序列 |
CreateMirrors(
String, String, Int32, Double)Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
segment | String | 搜索所使用到的种子序列片段 |
sequence | String | - |
maxDist | Int32 | 两个片段之间的最大的距离 |
cut | Double | - |