基因预测管线 整合ORF查找、打分、动态规划选择,输出最终预测结果
PredictionPipeline
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Annotation.Prodigal.PredictionPipeline
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Predict | 1 | 使用已有模型进行基因预测 |
| ComputeConfidence | 1 | 计算基因置信度(0-1之间) |
03 Fields
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| _minOrfLength | 1 | 最小ORF长度 |
04 Members
Predict(
IReadOnlyCollection(Of FastaSeq), TrainingModel)使用已有模型进行基因预测
ComputeConfidence(PredictedGene, TrainingModel)
计算基因置信度(0-1之间)
_minOrfLength
最小ORF长度