Location
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Assembly.NCBI.GenBank.GBFF.Keywords.FEATURES.Location
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| op_Implicit | 1 | parse the location string |
| JoinLocations | 1 | |
| ToString | 1 | |
| op_Explicit | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| JoinLocation | 1 | 对于环状的DNA分子,当某一个特性位点跨越了终点的时候,会有一个这个属性,本属性此时不会为空值 |
| Complement | 1 | 这个基因的位置是否在互补链 |
| Locations | 1 | join mutliple location for the extron. |
| ContiguousRegion | 1 | 假若目标对象是真核生物基因组的话,则可能会因为内含子的原因出现不连续的片段, 故而此时的Location.Locations属性会有多个值,这个属性会尝试将连续 的区域返回。对于原核生物而言,也可以直接使用这个属性来获取特性位点的在 基因组序列之上的位置 |
| Location | 1 | |
| UniqueId | 1 | |
| HasJoinLocation | 1 |
04 Members
op_Implicit(
String)parse the location string
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
strData | String | - |
JoinLocation
对于环状的DNA分子,当某一个特性位点跨越了终点的时候,会有一个这个属性,本属性此时不会为空值
Complement
这个基因的位置是否在互补链
Locations
join mutliple location for the extron. join(...,...,...)
Remarks
这个主要是应用于记录真核生物的mRNA外显子区域的位置,基于这个列表进行相应的序列片段提取,构建出一段完整的mRNA序列数据
ContiguousRegion
假若目标对象是真核生物基因组的话,则可能会因为内含子的原因出现不连续的片段, 故而此时的Location.Locations属性会有多个值,这个属性会尝试将连续 的区域返回。对于原核生物而言,也可以直接使用这个属性来获取特性位点的在 基因组序列之上的位置
Location
UniqueId
HasJoinLocation
JoinLocations()
ToString()
op_Explicit(Location)