Pathway

Full name SMRUCC.genomics.Assembly.KEGG.DBGET.bGetObject.Pathway Assembly SMRUCC.genomics.Core Members 6

The kegg pathway annotation data.

00 Remarks

(这个代谢途径模型是针对某一个物种而言的)

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Assembly.KEGG.DBGET.bGetObject.Pathway

02 Methods

Name	Overloads	Summary
IsContainsModule	1	Is current pathway object contains the specific module information?(当前的代谢途径对象是否包含有目标模块信息.)
GetCompoundCollection	1	Imports KEGG compounds from pathways model.
GetPathwayGenes	1	获取这个代谢途径之中的所有的基因。这个是安全的函数，当出现空值的基因集合的时候函数会返回一个空集合而非空值

03 Properties

Name	Overloads	Summary
modules	1	The module entry collection data in this pathway.
compound	1	The kegg compound entry collection data in this pathway.
references	1	Reference list of this biological pathway

04 Members

method IsContainsModule #

IsContainsModule(String)

Is current pathway object contains the specific module information?(当前的代谢途径对象是否包含有目标模块信息.)

Parameters

Name	Type	Description
`ModuleId`	`String`	-

method GetCompoundCollection #

GetCompoundCollection(String)

Imports KEGG compounds from pathways model.

Parameters

Name	Type	Description
`ImportsDIR`	`String`	-

method GetPathwayGenes #

GetPathwayGenes

获取这个代谢途径之中的所有的基因。这个是安全的函数，当出现空值的基因集合的时候函数会返回一个空集合而非空值

property modules #

modules

The module entry collection data in this pathway.

property compound #

compound

The kegg compound entry collection data in this pathway. (可以通过这个代谢物的列表得到可以出现在当前的这个代谢途径之中的所有的非酶促反应过程，将整个基因组里面的化合物合并起来则可以得到整个细胞内可能存在的非酶促反应过程)

property references #

references

Reference list of this biological pathway