KEGG reaction annotation data.
Reaction
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Assembly.KEGG.DBGET.bGetObject.Reaction
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| GetSubstrateCompounds | 1 | 得到本反应过程对象中的所有的代谢底物的KEGG编号,以便于查询和下载 |
| IsConnectWith | 1 | 通过查看化合物的编号是否有交集来判断这两个代谢过程是否是应该相连的? |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| ID | 1 | 代谢反应的KEGG编号,格式为R\d+,同时这个属性也是IKeyedEntity.Key |
| Equation | 1 | 使用KEGG compound编号作为代谢物的反应过程的表达式 |
| Enzyme | 1 | 标号: Enzyme.Identification |
| Orthology | 1 | KO list |
| Class | 1 | The reaction class |
| ReactionModel | 1 | 从Reaction.Equation属性值字符串创建一个代谢过程的模型 |
| Reversible | 1 | 这个反应过程是否是可逆的代谢反应? |
04 Fields
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| polymers | 1 | + (...) + m + n + [nm]-1 + [nm]+1 |
05 Members
GetSubstrateCompounds
得到本反应过程对象中的所有的代谢底物的KEGG编号,以便于查询和下载
Returns
a collection of the kegg id from the substrate list and product list
IsConnectWith(Reaction)
通过查看化合物的编号是否有交集来判断这两个代谢过程是否是应该相连的?
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
[next] | Reaction | - |
ID
代谢反应的KEGG编号,格式为R\d+,同时这个属性也是IKeyedEntity.Key
Equation
使用KEGG compound编号作为代谢物的反应过程的表达式
Enzyme
Orthology
KO list
Class
The reaction class
ReactionModel
从Reaction.Equation属性值字符串创建一个代谢过程的模型
Reversible
这个反应过程是否是可逆的代谢反应?
polymers
- (...)
- m
- n
- [nm]-1
- [nm]+1