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API Docs / SMRUCC.genomics.Core / Location

Location

Full name SMRUCC.genomics.Assembly.NCBI.GenBank.GBFF.Keywords.FEATURES.Location Assembly SMRUCC.genomics.Core Members 5

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Assembly.NCBI.GenBank.GBFF.Keywords.FEATURES.Location

02 Methods

NameOverloadsSummary
op_Implicit 1 parse the location string

03 Properties

NameOverloadsSummary
JoinLocation 1 对于环状的DNA分子,当某一个特性位点跨越了终点的时候,会有一个这个属性,本属性此时不会为空值
Complement 1 这个基因的位置是否在互补链
Locations 1 join mutliple location for the extron.
ContiguousRegion 1 假若目标对象是真核生物基因组的话,则可能会因为内含子的原因出现不连续的片段, 故而此时的Location.Locations属性会有多个值,这个属性会尝试将连续 的区域返回。对于原核生物而言,也可以直接使用这个属性来获取特性位点的在 基因组序列之上的位置

04 Members

method op_Implicit #
op_Implicit(String)

parse the location string

Parameters
NameTypeDescription
strDataString

-

property JoinLocation #
JoinLocation

对于环状的DNA分子,当某一个特性位点跨越了终点的时候,会有一个这个属性,本属性此时不会为空值

property Complement #
Complement

这个基因的位置是否在互补链

property Locations #
Locations

join mutliple location for the extron. join(...,...,...)

Remarks

这个主要是应用于记录真核生物的mRNA外显子区域的位置,基于这个列表进行相应的序列片段提取,构建出一段完整的mRNA序列数据

property ContiguousRegion #
ContiguousRegion

假若目标对象是真核生物基因组的话,则可能会因为内含子的原因出现不连续的片段, 故而此时的Location.Locations属性会有多个值,这个属性会尝试将连续 的区域返回。对于原核生物而言,也可以直接使用这个属性来获取特性位点的在 基因组序列之上的位置