生成Motif位点的序列
Site
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Interops.NBCR.MEME_Suite.DocumentFormat.MEME.LDM.Site
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| InternalParser | 1 | 解析MEME Text文件之中的位点数据 |
| ToFasta | 1 | Site.Name:Site.Start |
03 Properties
04 Members
InternalParser(
String)解析MEME Text文件之中的位点数据
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
s | String | - |
ToFasta(
String)Name
Site name,该目标序列的Fasta文件的文件头,一般是基因号
Site
位点的序列
Start
在整条序列之中的起始位置
Size
用作分析的原始序列的长度