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在目标基因组之上的blast hit的结果
HitRecord
00 Remarks
ncbi blast -outfmt 6
Fields: query id, subject ids, % identity, alignment length, mismatches, gap opens, q. start, q. end, s. start, s. end, evalue, bit score
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.NCBIBlastResult.WebBlast.HitRecord
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| .ctor | 1 | 请注意，在这里是按值复制 |
| SplitByHeaders | 1 | 当HitRecord.SubjectIDs之中包含有多个比对结果序列的时候，使用分号;作为分隔符将表头分开 |
| ToString | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| SubjectIDs | 1 | 不同的编号，但是都是代表着同一个对象 |
| QueryID | 1 | |
| QueryAccVer | 1 | |
| SubjectAccVer | 1 | |
| Identity | 1 | |
| AlignmentLength | 1 | |
| MisMatches | 1 | |
| GapOpens | 1 | |
| QueryStart | 1 | |
| QueryEnd | 1 | |
| SubjectStart | 1 | |
| SubjectEnd | 1 | |
| EValue | 1 | |
| BitScore | 1 | |
| data | 1 | |
| GI | 1 |
04 Members
#ctor(HitRecord)
请注意，在这里是按值复制
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
copy | HitRecord | - |
SplitByHeaders
当HitRecord.SubjectIDs之中包含有多个比对结果序列的时候，使用分号;作为分隔符将表头分开
SubjectIDs
不同的编号，但是都是代表着同一个对象
QueryID
QueryAccVer
SubjectAccVer
Identity
AlignmentLength
MisMatches
GapOpens
QueryStart
QueryEnd
SubjectStart
SubjectEnd
EValue
BitScore
data
GI
ToString()