Bootstrap 支持度评估:从原始比对中有放回地随机抽取位点(保留总位点数), 用同一算法重建树,重复成百上千次;每个内部分支在重抽样树中出现的频率即其支持度 (通常 ≥95% 视为高度可信)。
BootstrapAnalysis
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Interops.Visualize.Phylip.Evolution.Bootstrap.BootstrapAnalysis
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Run | 1 | 执行 bootstrap 支持度评估。 |
03 Members
执行 bootstrap 支持度评估。
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
matrix | CharacterMatrix | 原始比对位点矩阵 |
algorithm | EvolutionAlgorithm | 重建树所使用的算法 |
replicates | Int32 | 重采样次数(默认 100) |
options | EvolutionOptions | 算法参数 |
referenceTree | PhyloNode | 参考树;为空时使用原始矩阵按同一算法构建的树 |
parallel | Boolean | 是否并行执行重采样 |