操纵子预测参数。
OperonPredictionOptions
01 Syntax
SMRUCC.genomics.SequenceModel.RNA_Seq.Rockhopper.Operons.OperonPredictionOptions
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| DistanceMidpoint | 1 | 距离 sigmoid 的中点(bp)。 |
| DistanceScale | 1 | 距离 sigmoid 的斜率尺度。 |
| ProbabilityThreshold | 1 | 判定为同一操纵子的后验概率阈值。 |
| MinExpression | 1 | 参与比较的基因的最小表达量(RPKM),低于该值的基因不参与相似度计算。 |
03 Members
DistanceMidpoint
距离 sigmoid 的中点(bp)。
DistanceScale
距离 sigmoid 的斜率尺度。
ProbabilityThreshold
判定为同一操纵子的后验概率阈值。
MinExpression
参与比较的基因的最小表达量(RPKM),低于该值的基因不参与相似度计算。