单个重复实验、单个基因组(replicon)在正负链上的逐碱基覆盖度。
AlignmentCoverage
01 Syntax
SMRUCC.genomics.SequenceModel.RNA_Seq.Rockhopper.Core.AlignmentCoverage
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| PlusReads | 1 | 正链每个碱基上的读段数(1-indexed,索引 0 舍弃)。 |
| MinusReads | 1 | 负链每个碱基上的读段数(1-indexed,索引 0 舍弃)。 |
| AvgLengthReads | 1 | 该重复实验中比对上的读段的平均长度。 |
| ReadFileName | 1 | 原始读段文件路径(用于推断重复名称)。 |
| Name | 1 | 由原始读段文件名推断出的重复名称(去目录与扩展名)。 |
03 Members
PlusReads
正链每个碱基上的读段数(1-indexed,索引 0 舍弃)。
MinusReads
负链每个碱基上的读段数(1-indexed,索引 0 舍弃)。
AvgLengthReads
该重复实验中比对上的读段的平均长度。
ReadFileName
原始读段文件路径(用于推断重复名称)。
Name
由原始读段文件名推断出的重复名称(去目录与扩展名)。