运行期共享状态,保存 Rockhopper 执行过程中的全局参数与输出通道。
Logging
00 Remarks
复刻自原始 Rockhopper Java 版的 verbose 全局变量与 Output() 方法语义: 输出同时写入标准输出与 summary.txt(若已配置)。
01 Syntax
SMRUCC.genomics.SequenceModel.RNA_Seq.Rockhopper.Core.Logging
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Output | 1 | 输出一段文本到控制台,并在 Logging.SummaryWriter 存在时同步写入 summary.txt。 |
| OutputLine | 1 | 输出一行文本(等价于 Logging.Output()) 后追加换行)。 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Verbose | 1 | 是否输出 verbose 级别的详细信息(对应命令行 -v true)。 |
| SummaryWriter | 1 | 汇总输出文件(summary.txt)的写入器,为 Nothing 时仅输出到控制台。 |
04 Members
Output(
String)输出一段文本到控制台,并在 Logging.SummaryWriter 存在时同步写入 summary.txt。
OutputLine(
String)输出一行文本(等价于 Logging.Output() 后追加换行)。
Verbose
是否输出 verbose 级别的详细信息(对应命令行 -v true)。
SummaryWriter
汇总输出文件(summary.txt)的写入器,为 Nothing 时仅输出到控制台。