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TrackPlot
01 Syntax
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| .ctor | 1 | Creates plot element from the tracks data file. |
| GetProperties | 1 | SimpleConfig.GenerateConfigurations(Of <PlotType>)(Me)，需要手工复写以得到正确的类型 |
| GeneratePlotsElementListChunk | 1 | 生成当前这个绘图元素之中的所有的子配置块(<rules>、<axes>、<backgrounds>) |
| Save | 1 | Write the plot data document text into a given output stream. |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| file | 1 | 输入的路径会根据配置情况转换为相对路径或者绝对路径 |
| r1 | 1 | 圈外径(单位 r，请使用格式"<double>r") |
| r0 | 1 | 圈内径(单位 r，请使用格式"<double>r") |
| max | 1 | 自动推断出来的最大值不会被负值范围的附件性限制，用户手工赋值之后自动推断会被禁用 |
| min | 1 | 自动推断出来的最小值不会被负值范围的附件性限制，用户手工赋值之后自动推断会被禁用 |
| orientation | 1 | 圈的朝向，是Orientation.in向内还是Orientation.out向外 |
| thickness | 1 | To turn off default outline, set the outline thickness to zero. |
| axes | 1 | <axes><axis></axis></axes>: The radial grid lines of this track. |
| backgrounds | 1 | <backgrounds><background></background></backgrounds>: The colored background strips of this track. |
| BlockName | 1 | 当前的这个绘图元素所属的 circos 顶层配置块的名称。 (garantees only that the circos allowed top level blocks can be used, see lib/Circos/Configuration.pm in the circos distribution: my @ok = qw(ide… |
| ElementTag | 1 | 当前的这个绘图元素在配置文件之中所使用的 XML 标签名 (大部分的绘图元素都是plot标签，但是 link 使用的是link标签， highlight 在被输出到顶层 <highlights> 块之中的时候使用的是highlight标签) |
| tracksData | 1 | data文件夹之中的绘图数据 |
04 Fields
05 Members
Creates plot element from the tracks data file.
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
data | TrackDataDocument(Of `0) | - |
SimpleConfig.GenerateConfigurations(Of <PlotType>)(Me)，需要手工复写以得到正确的类型
生成当前这个绘图元素之中的所有的子配置块(<rules>、<axes>、<backgrounds>)
当没有任何子块的时候返回 Nothing
Stream, Encoding)Write the plot data document text into a given output stream.
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
file | Stream | - |
encoding | Encoding | - |
输入的路径会根据配置情况转换为相对路径或者绝对路径
圈外径(单位 r，请使用格式"<double>r")
圈内径(单位 r，请使用格式"<double>r")
The track is confined within r0/r1 radius limits. When using the relative "r" suffix, the values are relative To the position Of the ideogram.
自动推断出来的最大值不会被负值范围的附件性限制，用户手工赋值之后自动推断会被禁用
自动推断出来的最小值不会被负值范围的附件性限制，用户手工赋值之后自动推断会被禁用
圈的朝向，是Orientation.in向内还是Orientation.out向外
To turn off default outline, set the outline thickness to zero. If you want To permanently disable this Default, edit etc/tracks/histogram.conf In the Circos distribution.
<axes><axis></axis></axes>: The radial grid lines of this track.
<backgrounds><background></background></backgrounds>: The colored background strips of this track.
当前的这个绘图元素所属的 circos 顶层配置块的名称。 (garantees only that the circos allowed top level blocks can be used, see lib/Circos/Configuration.pm in the circos distribution: my @ok = qw(ideogram colors fonts patterns image plots links highlights))
plots(默认值), links 或者 highlights
当前的这个绘图元素在配置文件之中所使用的 XML 标签名 (大部分的绘图元素都是plot标签，但是 link 使用的是link标签， highlight 在被输出到顶层 <highlights> 块之中的时候使用的是highlight标签)
data文件夹之中的绘图数据
用户是否手工设置过TrackPlot.max值？如果用户手工设置过，则在绘图的时候不再自动推断
用户是否手工设置过TrackPlot.min值？如果用户手工设置过，则在绘图的时候不再自动推断