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SMRUCC.genomics.Analysis.HTS.P-NET 1.0.9753.40023.
01 Namespaces
SMRUCC.genomics.Analysis.HTS.P_NET
| Type | Summary | Members |
|---|---|---|
| AdamOptimizer | Adam 优化器（自适应矩估计） | 9 |
| DataSplit | 按照训练集 / 验证集 / 测试集划分之后的数据集三元组 | 4 |
| DeepLIFT | DeepLIFT（Rescale 规则）对 P-NET 做逐层归因 | 9 |
| DeepLIFTResult | DeepLIFT 归因结果 | 9 |
| DemoData | P-NET 演示数据合成器 | 7 |
| DemoDataset | 合成的演示数据集 | 6 |
| EvaluationResult | 一次评估所产生的全部指标结果 | 11 |
| GeneAlterationImportance | 某一个基因上特定改变类型的重要性 | 4 |
| GmtIO | Gene Matrix Transposed (.gmt) 格式的通路层级读写器 | 5 |
| HierarchyLevel | 单层生物学实体定义（通路层 / 基因层） | 9 |
| ImportanceAnalyzer | 跨样本聚合归因分数并对节点度做偏倚校正的解释分析器 | 5 |
| MaskedDenseLayer | P-NET 的核心算子：受二值掩码约束的稀疏全连接层 | 22 |
| Metrics | 二分类模型的评估指标 | 8 |
| NNBuilder | 把生物学层级"编译"为 P-NET 网络拓扑的构建器 | 3 |
| NodeImportance | 单个节点的解释结果 | 12 |
| PathwayHierarchy | 生物学层级本体：基因 → 精细通路 → 逐级抽象的粗通路 | 18 |
| PNETBuildConfig | 网络构建配置 | 4 |
| PNETForwardResult | 一次前向传播所产生的全部中间结果 | 7 |
| PNETModel | P-NET：生物学先验驱动的稀疏可见神经网络 | 20 |
| PNETSampleSet | P-NET 的样本数据集 | 15 |
| PNETTrainer | P-NET 的训练器 | 10 |
| PredictionHead | 深度监督预测头：挂在每一个隐藏层之后的 sigmoid 二分类输出节点 | 16 |
| SparseConnectivity | 稀疏连接内核：由生物层级父子关系编译出来的边表 | 13 |
| TensorOps | P-NET 所需要的基础数值算子 | 18 |
| TrainConfig | P-NET 的训练超参数配置 | 14 |
| TrainingHistory | 训练过程的历史记录 | 7 |