共线性结果的可视化数据:基因组×基因组共线性矩阵 + Top 基因组对排行
CollinearityDataset
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.PanGenome.ReportJSON.CollinearityDataset
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| matrix | 1 | 对称的共线性统计矩阵,单元格含义由 CollinearityDataset.metricLabel 说明 |
| metricLabel | 1 | 矩阵与排行所使用的统计指标名称(共线基因对 / 共线性区块数) |
| truncated | 1 | 是否因为规模上限而只展示了部分基因组 |
| genomes | 1 | |
| pairs | 1 |
03 Members
matrix
对称的共线性统计矩阵,单元格含义由 CollinearityDataset.metricLabel 说明
metricLabel
矩阵与排行所使用的统计指标名称(共线基因对 / 共线性区块数)
truncated
是否因为规模上限而只展示了部分基因组
genomes
pairs