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SV 信息熵散点图当中的一个基因家族样本点
SVDomainEntropyPoint
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.PanGenome.ReportJSON.SVDomainEntropyPoint
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| name | 1 | 基因家族ID |
| hCopyNumber | 1 | 该家族的 SV CopyNumber 矩阵行（跨基因组的拷贝数分布）的香农信息熵 |
| hMedian | 1 | 该家族的 SV Median 矩阵行的香农信息熵（按Median的精确取值统计频率） |
| zCopyNumber | 1 | Z-score 标准化之后的 CopyNumber 熵（散点图的X轴） |
| zMedian | 1 | Z-score 标准化之后的 Median 熵（散点图的Y轴） |
| presentGenomes | 1 | 该家族存在SV事件的基因组数量 |
| cluster | 1 | KMeans 聚类结果（按照簇中心确定性重排之后的簇编号） |
03 Members
name
基因家族ID
hCopyNumber
该家族的 SV CopyNumber 矩阵行（跨基因组的拷贝数分布）的香农信息熵
hMedian
该家族的 SV Median 矩阵行的香农信息熵（按Median的精确取值统计频率）
zCopyNumber
Z-score 标准化之后的 CopyNumber 熵（散点图的X轴）
zMedian
Z-score 标准化之后的 Median 熵（散点图的Y轴）
presentGenomes
该家族存在SV事件的基因组数量
cluster
KMeans 聚类结果（按照簇中心确定性重排之后的簇编号）