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SV 结构变异的信息熵散点图与 KMeans 聚类结果
SVDomainEntropyDataset
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.PanGenome.ReportJSON.SVDomainEntropyDataset
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| familyCount | 1 | 参与聚类分析的基因家族数量 |
| filteredCount | 1 | 因为出现频率过低而被过滤掉的基因家族数量 |
| clusterCount | 1 | KMeans 的簇数 |
| copyNumberEntropyLabel | 1 | X轴标题（CopyNumber 熵） |
| medianEntropyLabel | 1 | Y轴标题（Median 熵） |
| genomeCount | 1 | 参与统计的基因组总数（用于计算家族的出现频率） |
| points | 1 | |
| clusters | 1 |
03 Members
familyCount
参与聚类分析的基因家族数量
filteredCount
因为出现频率过低而被过滤掉的基因家族数量
clusterCount
KMeans 的簇数
copyNumberEntropyLabel
X轴标题（CopyNumber 熵）
medianEntropyLabel
Y轴标题（Median 熵）
genomeCount
参与统计的基因组总数（用于计算家族的出现频率）
points
clusters